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PNA探针是人工合成的肽核酸，有很高的稳定性与特异性，在以下四个领域得到了广泛的应用：

1） miRNA抑制剂（miRNA inhibitor)   

2） 反义药物研究和治疗领域 

3） 分子生物和功能基因组学的工具

4） 诊断用分子探针：telomere的FISH探针；Lightup探针；SNP鉴定探针；Microarray探针；

Nucleic acid biosensor探针

 

 PNA定制

u  PNA探针类型

      无标记的PNA

-N端的游离胺

           - N端的乙酰化作用

           带标记的PNA

            -N端和C端标记

            -双标记

           修饰PNA

氨基酸修饰其他适当的官能团修饰

Alpha 或Gamma PNA

-多标记的PNA骨架

-PNA骨架的附加功能

u  设计指南

1.       PNA有很好的亲和力一般只需13~18个碱基即可。

2.       富含丰富的嘌呤碱基的序列有聚集现象且溶解度降低。

-嘌呤碱基含量限于80%（建议不要超过60%）

-嘌呤碱基伸展最好不要超过5个

      3. 为增加溶解度可以在碱基序列中增加O linker (eg linker), E linker, X linker, 赖氨酸等溶解度促进因子。

      4. PNA的N端标记时，为避免杂交时标记分子的影响在PNA和荧光标记中间添加O linker等。

      5. PNA的C端标记是，C端的末端加入赖氨酸或者L-半胱氨酸后加标记。

u  标记物种类

标记	λads(nm)	λem(nm)	标记	λads(nm)	λem(nm)
FAM,FITC	492	518	OregonGreen488	498	526
TAMRA	553	576	AlexaFluor488	494	517
TexasRed	592	614	AlexaFluor532	530	555
TO	510	530	Cy3	550	570
Dabcyl	454	-	Cy5	650	670

此外还有很多种类的荧光标记物，具体请咨询。